قسم الاستقبال : وفيه يتم استقبال العميل وتسجيل بياناته وتسديد رسوم الخدمة.

وحدة سحب العينات : ويوجد بالمختبر قسمين لسحب العينات قسم للرجال وآخر للنساء.

وحدة تجهيز العينات : حيث يتم فرز العينات وفصلها وتوزيعها على الأقسام المختصة.

قسم الكيمياء :حيث يتم إجراء تحاليل الكيمياء الدم على الأجهزة المتخصصة في ذلك ، حيث يمتلك المختبر جهاز كوباس سي 311 وهو من أحدث الأجهزة في هذا المجال.

قسم أبحاث الدم : حيث يتم إجراء تحاليل عد الدم الكلي والنوعي وعدد الصفائح الدموية وكرات الدم الحمراء والهيموجلوبين ، ويمتلك المختبر جهاز سيسمكس وهو جهاز مشهود له بالتميز والدقة في هذا المجال.

قسم الهرمونات والفيروسات : وفيه يتم إجراء تحاليل الهرمونات والفيروسات من خلال أحدث الأجهزة المتوفرة في المختبر والتي تضم ثلاثة أجهزة – جهاز الإميوليت – جهاز إليكسيس – جهاز الليزون.

قسم البكتيريا : حيث يتم عمل المزارع لمعرفة الميكروبات الضارة واكتشاف المضادات الحيوية المناسبة لها.

قسم الكمبيوتر : وهو القسم المخصص لمراجعة النتائج وتجهيزها للمريض.